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原创 常见错误总结

一:可以使用微信或QQ,但无法打开网页其他博客的方法如下:1. 控制面板修改网络相关的信息,如修改DNS等2. 使用360断网急救箱以上方法尝试无效后,可能是因为上次关机前使用了VPN代理,在未关闭VPN代理的情况下直接关机,导致代理还停留在VPN中的配置,重新打开VPN,关闭代理即可。二:Microsoft visual c++ 14.0 is required...

2021-08-25 11:23:49 526 2

原创 openslid-python的安装

直接使用pip install openslide-python==1.1.1安装,不提示任何错误,且可以正常导入,但是运行的时候提示:No module named '_libvips'终端使用:sudo apt install libvips-tools

2020-06-05 19:37:24 704

原创 spam-python的安装

我的环境:python3.51. 进入pycharm终端,安装ATLAS(或者BLAS)sudo apt-get install libatlas-dev2.安装ATLASsudo apt-get install liblapack-dev3. 下载spams(我下载的是2.6.1的最后一个)4. 解压并安装tar zxf spams-python-v2.6.1...

2020-01-13 16:17:39 1420 6

原创 tensorfow模型转pytorch

参考链接:https://blog.csdn.net/weixin_42699651/article/details/88932670一. tensorflow模型转pytorch模型import tensorflow as tfimport deepdish as ddimport argparseimport osimport numpy as npdef tr(v):...

2019-12-31 10:05:22 1075 1

原创 Ubuntu终端pip安装tesnsorflow

1.直接pip install tensorflowpip._vendor.urllib3.exceptions.ReadTimeoutError: HTTPSConnectionPool(host='files.pythonhosted.org', port=443): Read timed out.下载速度非常慢,下载到96%(很稳定)会突然暴毙所有才有下面的22.手动指定源...

2019-12-13 20:55:19 162

原创 常见的错误及注意项

1.keras报错Please use `rate` instead of `keep_prob`. Rate should be set to `rate = 1 - keep_prob`.解决办法:将tensorflow版本由1.14.0降为1.5.0后,问题解决。2.ImageDataGenerator.flow_from_directory()的使用train_mask...

2019-12-13 16:33:57 1202

原创 打开loss日志文件

训练后可看到一个envents_out开头的文件,pycharm终端中运行以下命令:tensorboard --logdir=/home/my/桌面/注:envents_out开头的文件放在桌面,可见上述的路径不要具体到文件(到文件夹即可)...

2019-11-25 15:05:19 302

原创 安装Anaconda及module

1 下载anaconda先去官网 https://www.anaconda.com/distribution/#download-section 找到合适版本对应的下载网址然后输入命令:wget https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda3-2018.12-Linux-x86_64.sh2 安装anacondacd命令进入下...

2019-09-08 16:13:18 1207

原创 解决“libc.so.6: version GLIBC_2.14 not found”报错问题

找了很多博客,但是解决过程中经常碰到一些问题,博主也不说明怎么解决这些问题。。。。导致无法继续执行接下来的步骤,总结了一下:wget http://ftp.gnu.org/gnu/glibc/glibc-2.14.tar.gz wget http://ftp.gnu.org/gnu/glibc/glibc-ports-2.14.tar.gz tar -xvf glibc-2.14.ta...

2019-09-05 09:26:57 351

原创 Keras 笔记

1.keras.layers.Concatenate()#需要将维度指定参数写在内括号中x1 = Concatenate()([x1,DSOI],axis=-1)x1 = Concatenate(axis=-1)([x1,DSOI])https://blog.csdn.net/StupidAutofan/article/details/88666806...

2019-07-23 11:36:04 106

原创 单元推荐博客

留给自己看的。。。空洞卷积:https://blog.csdn.net/mao_xiao_feng/article/details/78003730正则化项:https://www.cnblogs.com/mtcnn/p/9411688.html

2019-07-08 11:02:32 80

原创 图片读取与显示

Image from PIL import Imageimg = Image.open('path')img.show() opencv import cv2 as cvimg = cv.imread('path')cv.imshow('image_name',img)cv.waitKey() matplotlib import matplotl...

2019-07-07 15:19:13 171

原创 解决:ImportError: No module named '_tkinter', please install the python3-tk package

调用 matplotlib 模块时,出现:ImportError: No module named '_tkinter', please install the python3-tk package意思是没有该模块,找了一些博客,大多都是建议直接pip3 install python3-tk,在pycharm 终端 pip3 install python3-tk,出现以下问题:解决办法...

2019-05-21 19:56:34 4640 1

原创 病理图像相关内容整理

乳腺癌论文:[1] Spanhol, F., Oliveira, L. S., Petitjean, C., Heutte, L.,A Dataset for Breast Cancer Histopathological Image Classification,IEEE Transactions on Biomedical Engineering (TBME),63(7):1455-...

2019-05-14 08:57:25 5833 7

原创 推荐博客

https://blog.csdn.net/eatapples/article/details/80205630 -----pytorch 实现alexNet + imagenet 部分数据https://blog.csdn.net/u010866505/article/details/77857394 -----不用框架,python实现卷积神经网络https://blog....

2019-04-17 19:07:26 174

原创 MICCAI-iseg2017挑战赛小结与婴儿脑组织分割总结

按照数据集进行划分:关于自动分割工具,婴儿脑MR图像来自单个时间点,其中纵向数据集不可用,因此必须开发不针对纵向数据集的分割工具,目前提出了一些机器学习方法,但这些方法的效果并不令人满意。iseg-2017:竞赛结果一共评估了两次,第一次评估中的TOP-1为MSL_SKKU,第二次评估中降为了第二名,但由于第二次评估的时间较晚,因此已发表的论文大多与第一次评估中的冠军作对比,在以下的总...

2019-04-17 15:26:43 5606 14

原创 python常用函数(一)

一:type(),dtype,astype()的用法type(a),a.dype--不要带括号,a.astype(str),当a中的为数组如[1,2,3]时,使用astype(str)会使得数组中的元素变为str类型二:isinstance(a,b)的用法a为变量,b为数据类型,.instance()无法判断两个变量是否为同一类型第二个参数可以为元组类型,若a为元组中参数类型的一种...

2019-04-17 15:26:26 412

原创 MICCAI MRBrainS脑组织分割挑战赛小结

仅关注MRBrainS2013与MRBrainS2018两个数据集针对MRBrainS2013:来源:MRBrainS2013挑战赛官网第一名:厦门大学第二名:华南理工大学第三名:北京邮电大学论文1:目前排名第7结果来源于:https://arxiv.org/pdf/1608.05895.pdfChen H, Dou ...

2019-04-17 15:26:14 6005 13

原创 使用pycharm出现黄色框的情况

一.不会造成影响出现重复变量名#第一个 a 会出现黄色框a = 5 a = 3实例类中的参数为list #这种情况下第二行 size 出现黄色框class unet(): def __init__(self,size=[28,28]): self.size = size def print_size(self): pri...

2019-04-12 15:56:01 14377

原创 医学图像中的部分评价指标小结

1.随机取块的方式相对于整张图片来说更容易收敛2.关于准确率与召回率的问题:    先理解这四个参数:TP、FP、TN、FN,在理解的时候,先看第二个符号,第二个符号代表我们的结果,第一个符号代表系统对我们的结果给出的判断。比如说TP,第二个符号P代表我们认为是正确的,T代表我们的猜测是正确的,那就说明真正的标签是正确的且我们猜对了。比如说TN,第二个符号N代表我们认为是错误的,T...

2019-01-05 15:45:16 1959

原创 利用GPU训练时的常见错误

1.CUDA_VIDIBLE_DEVICES=4,5 python3 main.py   我想在集群条件下利用4,5号GPU,由于模型较小,并不清楚是都可以指定4,5号GPU(内存占用情况看不出来。。。后续会找找其他验证办法),报了如下几个错误:all tensors must be on devices[0]:CUDNN_STATUS_INTERNAL_ERROR:目前找到了两个解决办法...

2018-11-24 16:03:03 1582

原创 pytorch-GPU分布式训练笔记

这篇博客可能会存在很多不正确的地方,麻烦大神指正,后期我会慢慢修改1.如果我有8片卡,但只想用其中的两片,比如显卡7和显卡8(假设索引从1开始,其实可能是0)我们先创建好模型:import torch.nn as nninport torchvision.models as modelsmodel = models.vgg16(pretrained = False)model...

2018-11-19 09:55:10 2944

原创 pytorch训练ImageNet笔记

 一:准确度的计算# 计算准确度def accuracy(output, target, topk=(1,5)): """Computes the precision@k for the specified values of k prec1, prec5 = accuracy(output.data, target, topk=(1, 5)) """ ...

2018-11-18 20:17:08 9216 5

原创 pytorch笔记(一)

1.Variable是神经网络中特有的一个概念,提供了自动求导的功能,在numpy中没有该功能,存在与torch.autograd.Variable().  通过data可以取出Variable中的tensor数值,grad_fn表示的是得到这个Variable的操作,比如是通过加减还是乘除得来的,最后grad是这个Variable的反向传播梯度。对于标量的求导x = Variable(...

2018-11-17 20:18:25 5178

转载 Ubuntu 16.04下安装64位谷歌Chrome浏览器

1.进入 Ubuntu 16.04 桌面,按下 Ctrl + Alt + t 键盘组合键,启动终端。2.在终端中,输入以下命令:sudo wget http://www.linuxidc.com/files/repo/google-chrome.list -P /etc/apt/sources.list.d/将下载源加入到系统的源列表。如果返回“地址解析错误”等信息,可以百度搜索其...

2018-11-17 20:13:32 234

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