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Fight Disease With Code ! Fight Disease With Data Technology ! 药学、医学、化学和生物与计算机和AI交叉的爱好者从业者。

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Nat. Med. | 制定指导原则以报告AI在临床试验中的使用

作者/编辑 | 王建民要在临床决策中发挥人工智能的潜力,就需要在设计良好的随机临床试验中测试干预措施,并以标准化和透明的方式报告这些结果。过去几十年发展起来的人工智能(AI)方法为生物医...

2020-09-18 00:03:00

Nat. Med. | 人工智能临床研究新指南

作者/编辑 | 王建民目前为止,由于医学中人工智能的临床试验数量有限,因此有关方案和报告的首份指南适时出现。更好的方案设计以及一致且完整的数据表示,将极大地促进这些试验的解释和验证,并有...

2020-09-18 00:03:00

RDKit | 基于RDKit 的化合物预处理

基于Python和RDKit对化合物数据进行预处理。环境MolVS是专门用于化合物预处理的库。rdkit 2020.03 molvs 0.1.1化合物(Compound)预处理RDKit:SanitizeMolKekure的形成,化合价的确认,芳香性的设定,结合等。参考:http://rdkit.org/docs/source/rdkit.Chem.rdmolops.htmlMolVS : Normarize参考:https://molvs.readth...

2020-09-16 19:20:33

JMC | 人工智能在药物发现中的应用:走进广阔的天地

作者/编辑 | 王建民JMC推出 "Artificial Intelligence in Drug Discovery "特刊,强调人工智能(AI)在制药研究中的新兴作用...

2020-09-14 00:03:00

Nat. Commun. | 机器学习在化学发现中的应用

作者/编辑 | 王建民2020年8月17日发表在nature communications上的一篇关于"Machine learning for chemical discove...

2020-09-10 07:32:16

拜耳与Recursion联手加强数字化药物发现

作者/编辑|王建民2020 年9月9日,拜耳与总部位于美国的Recursion 公司(一家从事药物发现产业化的数字生物学公司)已达成战略合作协议。该合作伙伴关系将利用Recursio...

2020-09-09 22:55:21

AAAI 2020 | 视觉问答方法中引入再注意机制

作者 | 涂心琪今天给大家介绍南开大学的Wenya Guo等人在AAAI 2020发表的文章“Re-Attention for Visual Question Answering”。作者...

2020-09-07 20:24:04

AAAI | 联合建模医学命名实体识别和标准化的神经多任务学习框架

作者 | 李芬审稿 | 涂心琪本期给大家介绍的是康奈尔大学Fei Wang教授课题组在AAAI-19上发表的一篇关于医学命名实体识别和标准化的文章。该文章提出了一种新的深层神经多任务学习...

2020-09-05 21:20:32

Nat. Rev. Neurol. | 机器学习在神经退行性疾病诊断和治疗中的应用

作者 | 朱玉磊审稿 | 李芬今天为大家介绍的是2020年6月谢菲尔德大学Laura Ferraiuolo教授课题组和BenevolentAI公司合作发表在Nature Reviews ...

2020-09-04 08:08:56

ProGen:蛋白质生成语言模型

作者 | 余梁指导 | 闵小平(厦门大学)今天给大家介绍的是一项由硅谷Salesforce Research的Ali Madani等人和斯坦福的Possu Huang教授课题组合作的工作...

2020-09-02 06:36:00

bioRxiv | AI辅助设计针对SARS-CoV-2的表位疫苗

作者 | 王建民COVID-19大流行病给社会带来的沉重负担,引发了开发治疗或预防战略的竞赛。其中,抗体和疫苗因其高度的特异性、药物间相互作用的概率低以及潜在的长期保护作用而特别具有吸引...

2020-08-30 23:58:26

ICML2020 | 基于贝叶斯元学习在关系图上进行小样本关系抽取

作者 | 朱玉磊审稿 | 李芬今天给大家介绍来自加拿大蒙特利尔大学Mila人工智能研究所唐建教授课题组在ICML2020上发表的一篇关于关系抽取的文章。作者利用全局关系图来研究不同句子之...

2020-08-30 13:04:22

bioRxiv | 生物发现和设计的不确定性学习

作者 | 涂心琪审稿 | 李梓盟今天给大家介绍麻省理工大学的Bonnie Berger教授课题组的一篇文章 “Learning with uncertainty for biologic...

2020-08-29 08:19:58

AAAI | 深度生成模型—NEVAE

作者 | 程玉审稿 | 朱玉磊今天给大家介绍的是印度理工学院Niloy Ganguly教授课题组在AAAI2019发表的一篇关于分子生成的论文。作者基于VAE提出一种新的分子图生成模型N...

2020-08-28 00:11:00

AI用于COVID-19的药物发现和疫苗开发

作者/编辑|王建民SARS-COV-2号召科学界采取行动,以对抗日益增长的大流行病。撰写本文时,还没有新型抗病毒药或批准的疫苗可用于部署作为一线防御。了解COVID-19的病理生物...

2020-08-27 07:00:00

ICML2020 | PGFS:如何保证生成分子是可合成的?强化学习来帮忙

作者 | 董靖鑫审稿 | 程玉今天给大家介绍的是来自蒙特利尔算法研究所、克莱姆森大学等联合发表在ICML2020上的文章。在本文中,作者针对目前新型化学结构的生成方法不能确保所提出的分子...

2020-08-25 12:35:54

ICML2020 | GCNII:使用初始残差和恒等映射解决过度平滑

作者 | 李梓盟审稿 | 董靖鑫今天给大家介绍中国人民大学魏哲巍教授课题组发表在ICML2020上的一项工作。针对目前大多数图卷积网络(GCN)模型因过度平滑而具有的浅层体系结构限制其模...

2020-08-24 12:29:37

NAACL| 基于标签感知的双迁移学习在医学命名实体识别中的应用

作者 | 李芬审稿 | 涂心琪本期给大家介绍上海交通大学APEX数据和知识管理实验室俞勇教授课题组发表在NAACL的文章“Label-aware Double Transfer Lear...

2020-08-22 21:48:46

RNA和机器学习:多维生物标志物的合理设计

作者|王建民过去的十年中,现代肿瘤疗法获得了重大的创新。现在是时候使用由合理设计和最新计算方法驱动的生物标记物。医学的早期,新疗法经常被“意外”发现。关于结构或功能的技术知识很少,无...

2020-08-20 06:36:00

Genome Research | TransBorrow:通过借用不同拼接工具的拼接结果来引导完成转录组拼接...

作者 | 金淑婷单位 | 厦门大学今天给大家介绍的是山东大学(威海)柳军涛课题组和沙特阿卜杜拉国王科技大学(KAUST)高欣教授课题组(http://sfb.kaust.edu.sa)发...

2020-08-19 07:00:00

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