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原创 windows cannot open clipbard错误

  我的系统是windows 10专业版,应该是在看pdf文档时ctrl+C按太多了,后来在IDE里边复制代码出现的错误,clipboard被其他程序锁定,所以不能打开。解决办法:  1.win + R,输入clipbrd ,回车,如果出现这种  网站上搜到解决办法大部分也都是针对这种情况的,不管剪切板有没有内容,点击编辑——删除,如果解决了,那皆大欢喜。  然鹅,我自己的情况是,操作完...

2019-12-27 12:23:06 1621

原创 linux git 问题:fatal: early EOF fatal: The remote end hung up unexpectedly fatal: index-pack failed

linux从github git较大的文件时出现的问题,查找以下,暂时关闭防火墙可行,或许还有其他好的解决办法,暂时记录下:出现问题:git clone --recursive https://github.com/arq5x/lumpy-sv.gitfatal: early EOFfatal: The remote end hung up unexpectedlyfatal: inde...

2019-11-06 09:21:37 972

原创 bam/sam文件格式小解(记录向)

这是一张自己截的sam文件图,bam文件是sam的二进制格式。仅供参考。sam文件一般比较大,读取sam文件在linux可以直接samtools view .sam,在windows下可以用LogView,也可以其他的读取程序第一行可以看到是15号染色体,长度信息,不用管。第二行显示比对工具和比对命令,也不用管。从第三行开始正文,每一行代表一个read的匹配信息。可以看到前两行名字(第一......

2019-10-11 16:12:04 2645

原创 生信就是个坑

文件动不动几十G上百G,就算平时几个G的搞起来都慢的要死。Linux是挺有意思的,但是要把Linux当做平时用的系统还是不习惯,各种不习惯,习惯了windows,Linux完全就是一脸懵。把我自己笔记本装上了Ubuntu,装是装上了,但打开的时候卡了我大概五个小时吧,没错我就是这么有耐心,最后装回了windows,装回windows的时候发现我的系统盘被割成了大大小小的萝卜丁,强迫症能忍?...

2019-01-17 11:16:06 4128 9

原创 Linux下bwa和samtools的安装

        这俩软件直接去github就能下载,bwa:https://github.com/lh3/bwa,samtools:https://github.com/samtools/samtools,下载下来是个压缩包,可以在终端解压也能解压之后在放进目标目录。一、bwa        解压完之后应该是这样的:然后在终端进到bwa-master那个文件夹下,直接输入make,等它...

2019-01-16 15:15:19 6180 8

原创 Linux更改环境变量(啥都不懂,能用就行)

刚开始学生信,计算机算是个小白,一点点底子就是会开关机。    在机器上装了个软件,是用来模拟SV的,但是只能在特定目录执行,还必须加“/."。    搜了网上许多更改环境变量的方法,无外乎以下几种:        只有用到最后一种$ vi ~/.bashrc,打开了个这个:      按E,看见了这个        ,第一个路径是jdk的路径,第二个是之前误打误撞写上去的,然后把...

2019-01-16 14:56:28 603

clipbrd.zip

windows出现cannot open clipboard错误,将此程序放入C:\Windows\System32\文件夹下即可

2019-12-27

人类基因组参考序列hg38.fa剪切工具clip.rar

从网站下载下来的hg38.fa非常大,不利于实验,这个工具可以从中提取单个染色体以便于实验,需要在linux中运行,运行命令在Readme.txt中。

2019-12-27

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