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原创 Linux系统：安装chainer，以及conda安装cudatoolkit、cupy
conda安装cudatoolkit、cupy和chainer目录conda安装cudatoolkit、cupy和chainer1. 安装方式2. 问题和解决办法2.1 问题：cupy安装失败2.2 解决办法参考资料1. 安装方式chainer是一个深度学习框架，如果想使用GPU进行加速计算，必须在装chainer之前装cupy。为了方便，推荐使用conda安装cupy。加入你已经装好了conda，cuda和它对应的驱动（nvidia-smi查看GPU版本和驱动）也安装好了。那么我们开始吧！第一步
2021-06-30 22:06:17
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原创 医学图像分割常用指标及代码（pytorch）
医学图像分割常用指标现在，医学图像分割有很多现成的工具包可以快速测量一些指标，比如。但是，我们还是要学习一下滴！该文章列出了一些常用的指标，并解释了它的原理。目录医学图像分割常用指标一、Classic measures1、What is T1、T0、P1、P0T_1、T_0、P_1、P_0T1、T0、P1、P0? [^1]2、What is TP、TN、FP、TN?3、Sensitivity (Recall, true positive rate)4、Specificity(true nega
2021-03-04 22:34:17
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原创 医学图像——数据读取和预处理（含代码）
目录3D图像读取1、ITK-SNAP 软件2、python包读取（1）nii数据——SimpleITK（2）nrrd数据图形预处理1、归一化处理2、裁剪、旋转、翻转3D图像读取1、ITK-SNAP 软件2、python包读取目的：获取array数据，转为tensor数据（1）nii数据——SimpleITKimport numpy as npimport osimport globimport SimpleITK as sitkfrom scipy import ndimageimp
2020-09-30 01:05:41
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原创 UNet 、3D-UNet 、VNet 区别
UNet 、3D-UNet 、VNet 区别医学图像的几个常用模型，简单总结一下。三个model的代码在我的Github上，可以参考一下：(https://github.com/VickyLLY/unet_liver_pytorch文章目录UNet 、3D-UNet 、VNet 区别一、UNet二、3D-UNet三、VNet一、UNet创新点：U型结构，下采样，上采样；短接通道（skip-connection）二、3D-UNet2D结构的U-Net是基本一样，唯一不同：2D操作换成了3D
2020-09-29 20:07:25
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原创 第29章 常用模块的使用
本章主要介绍 ansible 中最常见模块的使用。◆ 文件管理模块◆ 软件包管理模块◆ 服务管理模块◆ 磁盘管理模块◆ 用户管理模块◆ 防火墙管理模块。
2024-03-23 14:43:40
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原创 第28章 ansible的使用
本章主要介绍在 RHEL8 中如何安装 ansible 及 ansible的基本使用。◆ ansible 是如何工作的◆ 在RHEL8 中安装ansible◆ 编写 ansible.cfg 和清单文件◆ ansible 的基本用法。
2024-03-23 14:39:46
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翻译 翻译：Semi-supervised Medical Image Segmentation through Dual-task Consistency
Semi-supervised Medical Image Segmentation through Dual-task Consistency文献：Semi-supervised Medical Image Segmentation through Dual-task Consistency（基于双任务一致性的半监督医学图像分割）主题：Semi-supervised、Dual-task Consistency目录Semi-supervised Medical Image Segmenta
2021-04-09 23:03:19
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原创 项目管理软件Redmine
最近，在上一门系统综合设计课程，需要用到一个项目管理软件，要求是可以管理代码、生成甘特图、管理文档。我找了一下，觉得Redmine还不错，安装方便，功能多，最重要的是开源免费！项目管理软件Redmine1. Redmine简介和安装方式1.1 Redmine简介Redmine是用ROR框架开发的一套跨平台项目管理系统，十分简单、易用、方便。有很多优点：是开源免费的；多语言支持（已经内置了简体中文）；支持多种数据库，如MySQL、SQLite、PostgreSQL；功能丰富，如用户角色控制、问题追踪、
2021-04-09 11:23:00
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原创 Git命令
Git指令1、分支管理显示所有分支git branch -a切换git的HEAD分支（Git有一个名为HEAD的指针，它指向当前所在的本地分支（可以将其看作是当前分支的别名））git remote set-head origin git checkout 切换分支git checkout 创建分支git branch 2、查看查看状态git status查看git远程仓库git remote -v修改关联的远程仓库的方法第一种：使用 git remote set-url 命令
2020-11-10 11:59:25
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原创 使用 VS Code + Remote-SSH 插件在本地跑超算
使用 VS Code + Remote-SSH 插件在本地跑超算在此感谢bang哥（Skr.B），这篇文章就是白嫖他的，他一直安利VScode，但是我个人认为还是PyCharm连接ssh更香啊（配置比较简单，我就不写啦）哈哈哈~这篇文章他写了前面的部分，我补充了文件权限出错的解决办法，因为我们在按他的教程配置过程出现了多次这个错误！贼好用：连上后：目录使用 VS Code + Remote-SSH 插件在本地跑超算一、基本步骤安装 Remote-SSH 插件指定 `~/.ssh/config
2020-11-10 11:54:08
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原创 Git指令
Git指令目录Git指令1、分支管理2、查看1、分支管理创建分支git branch <branch name>切换分支,并且连接该分支git checkout <branch-name>查看分支#显示所有分支git branch -a#查看本地分支git branch#查看远程分支git branch -r切换git的HEAD分支（Git有一个名为HEAD的指针，它指向当前所在的本地分支（可以将其看作是当前分支的别名））git remote
2020-10-16 12:30:11
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原创 模型的不确定评估方式
模型的不确定评估方式在上面的一篇UA-MA的论文中，文献中的模型用一种不确定评估方式来过滤掉相对不可靠（高不确定度）的预测，只选择某些预测作为学生模型学习的目标。下面简单讲讲模型的不确定评估方式吧~参考文献：What Uncertainties Do We Need in Bayesian Deep Learning for Computer Vision? (NIPS 2017)不确定性类型：1、感知不确定性（Epistemic Uncertainty）特征：与模型相关，是由于训练不完全导致的。
2020-10-15 15:40:14
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翻译 Semi-supervised：Noisy Student
Semi-supervised：Noisy Student文献：Self-training with Noisy Student improves ImageNet classification论文原文链接GitHub代码链接主题：Semi-supervised，student-teacher model，noisy student目录Semi-supervised：Noisy StudentAbstract（摘要）1. 想解决什么问题？question2. 通过什么理论/模型
2020-09-22 01:57:13
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翻译 半监督方法：不确定性感知自增强模型
半监督方法：不确定性感知自增强模型文献：Uncertainty-aware Self-ensembling Model for Semi-supervised 3D Left Atrium Segmentation（半监督方法：不确定性感知自增强模型）原文：https://arxiv.org/abs/1907.07034代码：https://github.com/yulequan/UA-MT主题：semi-supervised, segmentation，Uncertainty estimatio
2020-09-19 23:53:00
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原创 卷积神经网络的分布式训练（三）分布式训练实战（pytorch框架）
卷积神经网络的分布式训练（三）分布式训练实战该专题是我本科毕设的各个知识点介绍和分析，以及一些实验结果展示。本科毕业了，研究生开学，又进入了一个新的学习阶段，那么趁着有时间就总结一下这个课题，分享给大家~如果你觉得对你有帮助，给我点赞吧！小女子能力有限，也欢迎大家批评指正。好啦，讲完基础知识，我们开始分布式训练吧。这一部分会涉及代码，如果有疑问的可以问我哈。目录卷积神经网络的分布式训练（三）分布式训练实战一、分布式整体方法设计二、分布式训练的实现一、分布式整体方法设计我们先来看图，比较直观。
2020-09-18 19:33:38
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原创 卷积神经网络的分布式训练（二）分布式训练相关理论
卷积神经网络的分布式训练（二）分布式训练相关理论该专题是我本科毕设的各个知识点介绍和分析，以及一些实验结果展示。本科毕业了，研究生开学，又进入了一个新的学习阶段，那么趁着有时间就总结一下这个课题，分享给大家~如果你觉得对你有帮助，给我点赞吧！小女子能力有限，也欢迎大家批评指正。目录卷积神经网络的分布式训练（二）分布式训练相关理论一、分布式类型一、分布式类型（1）单机多卡分布式单机多卡分布式是指在同一个机器上实现的分布式，这种分布式方式相对来说比较简单。一台机器上可以拥有多张GPU，每一张GPU卡
2020-09-18 15:52:39
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原创 卷积神经网络的分布式训练（一）ResNet
卷积神经网络的分布式训练（一）ResNet该专题是我本科毕设的各个知识点介绍和分析，以及一些实验结果展示。本科毕业了，研究生开学，又进入了一个新的学习阶段，那么趁着有时间就总结一下这个课题，分享给大家~如果你觉得对你有帮助，给我点赞吧！小女子能力有限，也欢迎大家批评指正。目录卷积神经网络的分布式训练（一）ResNet一、ResNet 介绍基本原理层次种类二、网络模型结构设计1、预处理模块2、基本单元3、池化层4、全连接层参考文献一、ResNet 介绍ResNet（Residual Neural N
2020-09-18 14:28:16
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原创 文献汇报模板
研究生期间，阅读大量的文献肯定是必不可少的，但是每次我读完一篇文章很快就忘了，特别是英文。。。所以，还是做做笔记吧，这是我自己总结的模板，分享给大家（适用于工科论文）汇报人：汇报时间：文献汇报模板文献汇报标题**研究背景****研究思路****主要结果****总结**文献汇报标题文献：主题：研究背景研究背景，多篇相关文章，文献引言进行一定延伸存在问题待解决问题研究思路数据来源研究方法？原理？实验设计？创新点主要结果据得到的数据做分析，将文章逻辑
2020-09-18 11:14:10
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原创 远程操作Linux的常用指令
Linux常用指令这是远程操作Linux系统时我常用的一些指令，还会继续更新的~文章目录Linux常用指令GXU_HPC基本操作sbatch 指令Conda+pytorchScreen指令TOP相关指令Scp命令ZIP指令ZIP指令GXU_HPC基本操作sinfo 查看队列和节点资源的占用情况srun -p [queueName] -w [nodeName] python main.pysrun -N [nodeNumber] python main.pysalloc 进行资源分配
2020-09-18 10:32:56
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原创 医学图像分割的初步理解
Time：2020/9/14医学图像分割的初步理解文献：1、Medical Image Segmentation Based on Deep Learning: A Review2、基于深度学习的医学图像分割方法_游齐靖3、基于深度学习的医学图像分割研究进展_宫进昌主题：medical image segmentation; CNN ; FCN; U-Net; Deep Learning研究背景医学图像特征：1、医学图像的模态（格式）更加多样化，如CT、MRI以及超声.
2020-09-17 00:21:50
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