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原创 python处理word文档(docxtpl 中文说明文档)

一 docxtpldocxtpl 一个很强大的包,其主要通过对docx文档模板加载,从而对其进行修改。主要依赖两个包python-docx :读写doc文本jinja2:管理插入到模板中的标签安装pip install docxtpl基本使用:from docxtpl import DocxTemplatedoc = DocxTemplate("my_word_te...

2019-03-16 23:43:33 36923 10

原创 perl 钻石操作符中遇到的一些问题

示例在下列代码中,我想获取利用()连续文件的前三行,但在单独获得第四行时候;对应的输出为空open IN,"$ARGV[0]" ;($A,$B,$C)=(<IN>,<IN>,<IN>);$D=<IN>;print $D;在下列代码中,输出为才正确open IN,"$ARGV[0]" ;$A=<IN>;$B=

2019-03-03 18:01:34 349

原创 HIC-hicup软件安装说明

HiCUP是一个处理由Hi-C和捕获Hi-C(Capture Hi-C,CHi-C)产生的测序数据的流程,它们是用于研究三维基因组组织的技术。流程比对数据到一个指定参考基因组,并去除可能阻碍随后分析的假象。HiCUP也产生一个易于解释,但详细的质控(quality control,QC)报告,它帮助改善实验方案以用于未来研究。软件是免费可获得的官网地址:http://www.bioinform...

2018-08-04 21:45:49 2082

原创 samtools 生成bcf文件报错:[bcf_sync] incorrect number of fields (0 != 5) at 0:0

起源用samtools 生成bcf文件,命令如下samtools mpileup -ABuf ref.fa L.bam >L.raw.bcf错误输出文件一直增大。但是bcf文件内容只有表头,bcf文件有一行以下信息 [bcf_sync] incorrect number of fields (0 != 5) at 0:0提示如下: /opt/grid...

2018-08-04 13:06:45 977

空空如也

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