寂静前行-CSDN博客

原创 R语言-生存分析与结果的图像处理

R语言-生存分析与结果的图像处理数据准备：library("survival")library("survminer")data("lung")调用“lung”数据集，使用head()命令调查前6行，得到以下结果： inst time status age sex ph.ecog ph.karno pat.karno meal.cal wt.loss1 3 306 ...

2020-01-18 17:40:38 9301 4

ROC曲线，多用于二分类问题的评价，通过选取合适的截断值（阈值threshold）便能得出AUC。但很多时候我们只是单纯地通过掉包来计算AUC并绘制ROC曲线，其中的原理和最佳阈值的筛选往往被人们忽略。同时笔者最近的项目中需要重新温习这些小细节，故撰文积累一下。（本文不以实际用途出发，若只想得出结果可以看看这篇：https://blog.csdn.net/m0_45248682/article/details/104080913）

2021-04-19 00:33:42 18367 1

原创零代码构建系统发生树-冠状病毒系统发生树

MEGA6构建系统发生树官网地址：原官网页：https://www.megasoftware.net/MEGA简介：MEGA软件是一款遗传学分析软件，可以完成基本的序列比对，系统发生树构建和BLAST搜索，本文将简述其基本操作步骤，全程界面操作。数据来源申明：数据来源于ncbi中18种冠状病毒的基因序列，包括新型冠状病毒ncov-2019，SARS，中东呼吸症，蝙蝠的冠状病毒等等，以f...

2020-02-27 21:44:27 1196

原创学习笔记(02):人工智能-数学基础视频课程-T检验应用条件

购买课程后，可扫码进入学习群，获取唐宇迪老师答疑数据科学与人工智能数学基础课程旨在帮助同学们打下数学基础，通俗讲解其中每一个知识点。课程内容涉及高等数学，线性代数，概率论与统计学，同学们在学习过程中应当以理解为出发点并不需要死记每一个公式，掌握核心知识点。课程章节内容较多，初级同学按顺序学习即可，有基础的同学们可以按照自己的需求来有选择的学习！...

2020-02-15 11:15:27 264

原创学习笔记(01):人工智能-数学基础视频课程-python工具包介绍

购买课程后，可扫码进入学习群，获取唐宇迪老师答疑数据科学与人工智能数学基础课程旨在帮助同学们打下数学基础，通俗讲解其中每一个知识点。课程内容涉及高等数学，线性代数，概率论与统计学，同学们在学习过程中应当以理解为出发点并不需要死记每一个公式，掌握核心知识点。课程章节内容较多，初级同学按顺序学习即可，有基础的同学们可以按照自己的需求来有选择的学习！...

2020-02-12 10:14:10 171

原创 R语言卡方检验与结果可视化---ggstatsplot包

R语言卡方分析与结果可视化1，卡方分析简介2，R语言chisq.test()3，基于ggstatsplot包的可视化分析

2020-01-26 12:31:01 13981 16

转载 R语言卡方检验--ggstatsplot包参数说明

ggstatsplot包参数说明ggbarstats函数：ggbarstats( data, main, condition, counts = NULL, ratio = NULL, paired = FALSE, labels.legend = NULL, results.subtitle = TRUE, stat.title = NULL, sam...

2020-01-26 12:29:17 4662

原创 ROC曲线基于R语言-（pROC包）

R语言ROC曲线ROC曲线简介：很多的模型在进行分类预测时，会产生一个实际值或者概率值，然后我们将这个预测值与一个用于分类的阈值进行比较，将结果分成正类和反类。一般我们可以通过任务需求的不同来采用不同的截断点。在绘制ROC曲线前，我们根据学习期的预测结果对样例进行排序，按照该顺序计算出横纵坐标，纵轴是“真正例率”（TRP），横轴是“假正例率”（FPR），图像与x=1,y=0的直线围成的面积为A...

2020-01-24 16:52:53 34149 13

原创 R语言生信绘图配色（ggsci包）--SCI论文配色

R语言生信学习-ggsci包介绍–SCI论文的配色对于我这条使用R语言来绘图的生信????而言，最令我绝望的便是关于配色的问题了，很多时候自己选的颜色看上去会特别生硬，就算使用colorRampPalette产生渐变色也感觉不够理想。无意间，我看到了“ggsci”这个包，它完全就是为了SCI配色而设计的，下面我将挑选一些重要的来讲，详细的内容可以去看官网的说明。内置函数介绍：这些是帮助页面中的函数...

2020-01-23 21:10:26 19202 1

原创 R语言图像素描效果的实现（基于rimage包）---娱乐向

R语言图像素描效果使用效果预览前言代码分享细节参考文献使用效果预览：前言：之前在b站看视频的时候，无意间看见有的up主在使用matlab做图像锐化，便突发奇想，想在R语言里面也整一个看看。虽然网上有的大佬已经通过“rimage”实现了这个目的（已经将大佬的文章链接附在文后了），但是其中“rimage”包已经被移除了，不方便直接使用。为了解决这个问题，我找到了原始的“rimag...

2020-01-21 23:14:23 860

原创 CNCI的使用--RNA蛋白编码预测软件

（生信）RNA蛋白编码预测软件-CNCI的使用CNCI简介：CNCI是由中科院研发的一款基于SVM（支持向量机）的LncRNA预测软件，它可以不依赖于已知的RNA注释信息来进行预测，同时其对不完全转录和反义的RNA有着良好的分类效果，本文将根据github的说明总结一些简单的操作。软件安装与准备：linux 32位或者linux 64位系统python 2.74或者2.0版本（详细安装...

2020-01-18 15:53:32 5534

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