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RSS订阅原创 RepeatModeler2.0.4的安装和使用（包含RepeatMasker安装）-2023.07更新
本教程安装软件版本：rmblast 2.14.0+，TRF 4.10，RECON，RepeatScout 1.0.6，RepeatMasker 4.1.5，GenomeTools 1.6.2，LTR_Retriever v2.9.6，Ninja 0.95-cluster_only， MAFFT 7.453，CD-HIT 4.8.1 )*-families.stk : Seed alignments，可以提交到 Dfam 数据库的Stockholm-formatted文件。
2023-07-19 12:02:27
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原创 基因预测软件：【BRAKER3】软件的安装
BRAKER3是BRAKER套件中的最新管道。它使RNA-seq和蛋白质数据能够在全自动化管道中使用GeneMark-ETP和AUGUSTUS训练和预测高度可靠的基因。该流水线的结果是两个基因预测工具的组合基因集，其中只包含有高外部证据支持的基因。BRAKER3与BRAKER2安装和pipeline略有不同。
2023-04-28 10:25:15
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原创 RepeatMasker数据库更新（Dfam3.6数据库与RepBase的合并）解决 famdb.py：TypeError: ‘NoneType’ object is not iterable报错问题
RepeatMasker数据库更新（Dfam3.6数据库与RepBase的合并）解决 famdb.py：TypeError: 'NoneType' object is not iterable报错问题
2022-09-22 11:14:08
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原创 安装dnaPiPeTE过程中遇见的问题
安装dnaPiPeTE过程中遇见的问题./aligns/KmerAlignCore.cc:6:34: fatal error: aligns/KmerAlignCore.h: No such file or directory #include "aligns/KmerAlignCore.h”在进入到这个文件夹后发现，是存在有KmerAlignCore.h这个文件的，这个问题是因为在编译Trinty2.5.1软件中的Chrysalis部分过程中，编译器版本
2021-09-04 15:53:10
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原创 RepeatModeler的安装（包含RepeatMasker安装）
RepeatModeler的安装（包含RepeatMasker安装）nym2021-8-15RepeatMasker官网地址（http://www.repeatmasker.org/）安装RepeatMasker需要TRF、rmblastTRF的安装#下载（https://github.com/Benson-Genomics-Lab/TRF）git clone https://github.com/Benson-Genomics-Lab/TRF.git#Check actual versio
2021-08-21 10:57:12
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空空如也
空空如也
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