- 博客(104)
- 收藏
- 关注
RSS订阅原创 Endnote文章编号从10开始
左侧Insert Citation-Tools-Configure Bibliography-layout。在word中点击Endnote，instant Formatting is on右下角有一个小箭头，前部分章节已经写好，后续添加，endnote参考文献需要从特定序号如10开始。下边有一个Start with bibliography。里面输入要开始的参考文献标号，点开箭头后点击layout,
2024-01-21 07:55:12
583
原创 score_inverse_problems运行环境，pycharm重新安装，jax,jaxlib的GPU版本安装-230831
pycharm重新安装，jax，jaxlib的GPU安装踩坑
2023-08-31 09:48:37
749
原创 ubuntu通过nautilus隐藏/home下Documents等文件夹-230616
ubuntu下希望隐藏home下的documents等文件夹，让home下看的更清爽写。
2023-06-16 20:34:14
224
原创 ubuntu下截图软件flameshot-230616
Ubuntu 18.04下截图软甲，类似windows下的snapaste，用的习惯。安装记得当时出错了一次，后来更换了一次版本后正常。系统设置->键盘->快捷键->自定义快捷键。command为flameshot gui。name为flameshot,
2023-06-16 16:53:07
172
原创 pytorch中指数移动平均ema权重的理解、opt理解-230618
之前理解ema权重是在train阶段使用，提升网络性能，在https://github.com/openai/improved-diffusion中一直没有找到train是ema权重的使用，变化的使用是model权重（如果使用的话还需要将ema权重数值传给model权重，然后得设置为有梯度），后来查找ema权重只在train中根据model权重更新，在测试时使用。
2022-04-03 20:08:39
224
原创 220304-QQ管家工具箱“浏览器保护“”设置chrome谷歌浏览器为默认浏览器
一直以来自己win7系统默认浏览器为QQ浏览器，由于自己习惯chrome的插件，因而非常麻烦。搜索了很多方法，注册表，chrome设置、控制面板等均未成功。最后找到了可行的方案：Win7中如何将 Google Chrome设置成默认浏览器采用QQ管家工具箱里的“浏览器保护”，成功！...
2022-03-04 09:28:46
318
原创 211215-SPSS统计再理解
今天就统计问题请教了下钱老师，有了新的理解，相关问题做个记录。检验数据是否符合正态分布何时使用非参数检验配对样本的非参数检验『Wilcoxon符号秩检验』多个独立样本的非参数检验及两两比较...
2021-12-16 08:33:50
69
原创 211209-word利用VBA宏命令投稿将修改处标蓝色
文章修改稿中如何将修订的地方批量自动标红利用Word自带的VBA功能就可以实现，在word审阅模式下修订的地方批量自动标红，具体步骤如下：在Word下利用比较功能，将2个版本的论文修改的地方识别出来（审阅模式），打开比较后的文档，作为需要标定的目标文件。键入ALT+F11，打开Word的VBA环境点击主菜单下的工具栏第二个工具-插入模块-模块，进入代码界面在出现的代码窗口中，粘贴代码：Sub 更改修订插入内容的颜色()Dim n As IntegerFor n = 1 To
2021-12-09 17:01:30
844
原创 211126-Matlab借助CT头文件重写金马扬名导出的MR
itk-snap无法读取金马扬名导出的MR，santeDICOM Viewer可以。下面代码使用matlab借助CT的头文件重新MRpatient_path = 'C:\Users\MrXie\Desktop\ART-CMR148167';patient_outpath = [patient_path, '_out'];if ~exist(patient_outpath, 'dir') mkdir(patient_outpath)endnames = dir(patient_path);
2021-11-26 17:47:12
139
原创 211126-Matlab改写金马扬名导出CT的seriesID
金马扬名导出CT的seriesID不是一致的，所以一个患者CT导入itk-snap会被分成一个，如下进行更改seriesID。MR这钟方法不可行，需借助notebook++.patient_path = 'C:\Users\MrXie\Desktop\CMR148167-CCT374784';patient_outpath = [patient_path, '_out'];if ~exist(patient_outpath, 'dir') mkdir(patient_outpath)end
2021-11-26 17:39:33
143
原创 211126-Matlab读取mhd文件并转为dcm
Matlab读取mhd文件并转为dcm，做此记录，后续再进行更改。clc; clear; close allid = fopen('CT_FCN/CT_predicted_3.raw');imgs = fread(id,'int16');%以'short'数据类型打开，因为本人存储的raw数据是以short保存的imgsize = size(imgs);%读出的图像的size为n*1大小rows = 320;%根据mhd文件的图像大小设定clos =192;nums = imgsize(1)/
2021-11-26 17:35:39
693
原创 211123-python保存图像cv2.imwrite和plt.savefig
展示是需要保存成png格式，做此记录。cv2.imwrite可以输出512*512图像，但需要自己提前处理成0只255。img_CT = np.clip((img_CT - 500) / (2500-500), 0, 1) * 255cv2.imwrite('CT',img_CT)plt.savefig可以输出与plt.show()一样，下面的输出为1087*1087。自己根据需要进行选用fig,ax=plt.subplots(figsize=(6.4,4.8), dpi=300)plt.i
2021-11-23 13:53:32
3103
原创 211018-pycharm下使用git
setting-github登录，一般账号密码等不不上，使用tokenVCS-git from github，地址一般第一次连不上，ssh-keygen再操作一遍，第二台电脑pycharm选择New后面就是正常的版本控制
2021-10-19 14:11:48
88
原创 211004-pandas处理数据(缺失值、分类变数值型）
#删除缺失值过多的列，和观察判断来说和预测的y没有关系的列data.drop([“Cabin”,“Name”,“Ticket”],inplace=True,axis=1)#处理缺失值，对缺失值较多的列进行填补，有一些特征只确实一两个值，可以采取直接删除记录的方法data[“Age”] = data[“Age”].fillna(data[“Age”].mean())data = data.dropna()#将分类变量转换为数值型变量#将二分类变量转换为数值型变量#astype能够将一个panda
2021-10-14 14:32:56
539
原创 210928-git学习记录
git initgit add readme.txtgit commit -m “wrote a readme file”git add readme.txtgit commit -m “add distributed”git add readme.txtgit commit -m “append GPL”git loggit log --pretty=oneline用HEAD表示当前版本，也就是最新的提交1094adb…（注意我的提交ID和你的肯定不一样），上一个版本就是HEAD^，上上
2021-10-07 14:50:47
77
原创 211003-Graphviz配置尝试记录
机器学习——决策树的可视化配置graphviz +windows+pygraphcizdPython3.5在jupyter中使用graphviz画决策树（包括graphviz-2.38.msi的安装）按照这个配置pycharm可以正常使用，但jupyter仍不行。pip uninstall graphvizconda install python-graphvizjupyter可行，但pycharm不可用，而且没有graphviz.Source了...
2021-10-04 08:16:42
103
原创 210930-截图等用的习惯软件记录
Dear editor,Thank you for your warningETHICS STATEMENTThis study was approved by the Research Ethics Board of the Second People’s Hospital of Changzhou, Nanjing Medical University . Written informed consent was not required in accordance with national a
2021-09-30 08:20:38
51
原创 210928-Matlab读取写入npy格式(npy-matlab工具箱)
npy是python下numpy矩阵格式，对于医学图像也常用，以前自己是下载好readNpy.m文件放在matlab当前目录中，文件多了影响使用，应放在toolbox中，方便调用1、下载安装https://github.com/kwikteam/npy-matlab>> addpath('./npy-matlab/npy-matlab') >> savepath（Linux下savepath会报错:Unable to save path to file ‘/usr/lo
2021-09-28 10:56:33
4970
原创 210928-Matlab读取文件夹及.nii格式
自己时常花费较多时间用于寻找及回忆命令上，不应该，因此做些记录，更快的恢复记忆。% read the whole filespatient_paths='patient_paths';patient_names=dir(patient_paths);for ii=3:length(patient_names) % start from 3 patient_name=patient_names(ii).name; patient_path=fullfile(patient_paths
2021-09-28 09:55:11
809
原创 210928-Matlab和SimpleITK保存和读取nii格式及其差异
引文： nii格式是医学图像常用格式，类似mhd，可以显示三维信息。以前使用.npy格式，主要是无法直接查看，因此考虑了解nii格式。1、Matlab添加工具箱NIfTI的方法python下SimleITK(简写为sitk)也可以保存nii。sitk读取matlab和sitk保存的nii没有差异。matlab读取matlab和sitk保存的nii有差异。差异来源于nii中头文件差异，具体也不清楚。具体应打开图像后再自行检查。# read by sitksitk.ReadImage(ct_pat
2021-09-28 09:48:06
742
原创 210927-Matlab并排显示imshowpair(imga,imgb,‘montage‘)
Matlab并排显示两幅图，用于比较两幅图大小可以不一样，imshowpair会按大的显示，还有就是范围可以不一致，相当各自显示。imshowpair(imga,imgb,'montage')类比imshow(cat(imga, imgb, 2), [])后续还补充显示问题。...
2021-09-28 09:20:24
4000
原创 210918-放疗gamma通过率matlab代码
引文：放疗中常用通过率，一种是使用matrixx软件(比较平面)，ArcCheck软件(比较探头所在平面)，另一种是使用代码，这里仍然来自Niubi高，做此记录，不然下次就找不到了。gamma2.mfunction [Ir,r] = gamma2(img,I,ra,dta,ps)%绝对剂量伽马分析；img为参考剂量分布图，I为计算剂量分布，Ir为gamma因子分布，r为通过率,ps为pixelspacingmaximg=double(max(img(:))); %小数除以整数会得到错误结果[sx,
2021-09-18 10:43:56
1394
1
原创 210918-使用matlab借助其他dcm头文件写入dicom（输出文件名排序sort_nat）
引文：前阵子林老师使用双能CT，导出文件Monaco导入报错，但在软件上可以正常读出，原因是方向[1,0,0,0,1,0]改动了，变成[0.999,0,0.01,0,0.99,0.01]这样。直接改回成[1,0,0,0,1,0]仍不能导入monaco，于是借尸还魂，使用替他头文件写入。PS：先用ImageJ检测dcm顺序与图像顺序是否统一，不然需要做resort操作。我另一篇文章写过。clc; clear all ; close all;%%for j = 1:5 path = ['G:\0
2021-09-18 10:25:59
1007
1
原创 210917-电脑护眼模式总结
引文：长时间用电脑，设置电脑颜色为豆沙绿，可以保护眼睛，做此记录。1、win7全局设置：右键个性化；下方窗口颜色；高级外观设置；项目选择窗口，颜色为色调85,饱和度123,亮度205。此设置对matlab、word等有效。2、福昕风腾阅读器：文件->偏好设置->访问；自定义颜色，设置如上颜色；3、谷歌浏览器：搜索插件《保护眼睛》，有两个，选择作者久远寺千歳的，就可以了。...
2021-09-17 15:09:12
1036
原创 210828-时间管理感悟
自己时间管理上存在很大缺陷，现在记录自己一点所想，供以后翻阅看看。有时一分神，一拿手机再放下，五分钟就过去了不要整太多仪式，大多数时间都可以有效利用常自我安慰，自我放松...
2021-08-29 08:45:27
55
原创 210824-科研能力不行十宗罪
引言：自己一直以来，科研写作都没有大的进展，经过自己反思，自己常年踩坑，现在总结自己日常犯的错，谓之“十宗罪”。极少时间进入心流；漫无目的，想学什么学什么，浅尝辄止；前期调研不充分，后续讨论常干涩无内容；所谓理想派，没准备好不开始；文件混乱，后续难以找到自己想要的，或者花很长时间；不懂得如何问人，沉浸在自己小世界；同1，忙一会就会给自己放小假；虚假的认真，周末和晚上时常过来，有用时间又有几何？难以跟踪一个目标，做不下去心安理得给自己找理由；缺乏野心，得过且过，自我感觉还不错。..
2021-08-24 09:38:39
88
原创 210812-Matlab获得图像中鼠标点击坐标
引言Matlab图像处理中，有时需要获得鼠标在图像中点击的坐标值，以下是调用代码。代码如下：function [x,y]=get_cursor_value(image,title_name)% img=dicomread(image); fig=figure; imshow(image,[]) title(title_name); title(title_name,'Interpreter','none') set(gcf,'position',[0,
2021-08-12 16:17:34
3476
原创 210812-dicom文件排序并重命名
引言默写情况下，dcm文件导出后虽然名字为1001.dcm，1002.dcm，…，但是并非连续的，1002.dcm可能是第10层，为了后续后处理，前期可以将dcm文件序号和层数对应上代码如下：clc;clear;close all;%%patients = dir('data_czey/Y*');for ii = 1:numel(patients) % 遍历病人 patientname = patients(ii).name; disp(['----------------
2021-08-12 16:11:59
909
1
原创 210805-word粘贴选项按钮丢失解决
1.使用word2013中遇到一个问题，就是复制后没有粘贴选项，所以每次复制都是右键后挑选，很不方便，后来终于找到解决方案了，做此记录！解决方案网址：Word和Onenote“粘贴内容时显示粘贴选项按钮”选项问题。具体如下：如果是这样的话那么建议您在word中尝试下尝试到 C:\用户\你的用户名\AppData\Microsoft\Templates文件夹，查看Normal.dot模板文件，删除或重命名Normal.dot模板，重新打开Word。可以在之前进行备份。然后尝试下修复下office：
2021-08-05 20:36:24
1230
1
原创 210726-Excel查找指定位置数值用于loss绘图准备（Match和Indirect函数）
当时是epoch列，有多个1,2,3，使用Match查找第一个1,2,3的位置S1=MATCH(R1,B:B)通过S1得到的行号，得到对应的loss值S2=INDIRECT(ADDRESS(S1,10))
2021-07-29 08:50:44
389
原创 word中引用endnote卡顿解决-210625
word中引用endnote卡机的的解决方案word在使用Endnote时变得非常卡解决办法存在问题：word中一旦引用endnote参考文献，就会出现卡顿现象解决方案：word中依次选在文件→选项→校对→在word中更正拼写和语法时→键入时标记语法错误。取消这个选项，问题得以解决。Mark以下，有效！...
2021-06-25 16:39:40
2371
原创 PyQt5的GUI学习记录-210422
1.刚开始硬刚代码，后来发现后个UI设计界面，做此记录PyQt5 Designer + Pyside2 uic 图形界面设计拖拽 ui文件转python代码PS: 注意是自己需要将PySide2-uic换成pyuic5，查看位置可以使用which命令，如which designer和which pyuic52. 主要参考代码https://github.com/run-youngjoo/SC-FEGANhttps://github.com/lyndonzheng/Pluralistic-Inpai
2021-04-22 15:32:28
53
原创 python下opencv简易GUI学习记录-210318
1.GlobalLocalImageCompletion下简易GUIhttps://github.com/shinseung428/GlobalLocalImageCompletion_TF/blob/master/test.py核心代码：drawing = False # true if mouse is pressedix,iy = -1,-1color = (255,255,255)size = 10def erase_img(args, img): # mouse call
2021-03-18 10:32:18
151
空空如也
空空如也
TA创建的收藏夹 TA关注的收藏夹
TA关注的人