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ysugarr‘s 科研之路

工欲善其事 必先利其器pdf阅读以及备注用的软件:PDF element,比较好用,就是有的时候可能会有点崩;后续可能会考虑使用Adobe acrobat;论文下载:平常都用http://gen.lib.rus.ec/,这里下载不到的,会直接google,基本上95%都能下到;如何能把 CAJ 格式文档转换成 PDF 格式?我用的是脚本,也太好用了!论文写作能力:coursea有一个science writing的课程,正在积极跟进中;英语单词:Merr...

2020-07-29 20:28:53

Writing in the Sciences Week 2

动词的使用使用主动语态Agent of the action:doing the actionRecipient of the action:receive the actionPassive:The activation of Ca++ channels is induced by the depletion of endoplasmic reticulum Ca++ stores.Active:Depleting Ca++ from the endoplasmic reticulum acti

2020-07-24 00:40:58

Writing in the Sciences Week 1

什么可以被称作一个good writer:有一些要说的逻辑思维一些简单的,可习得的技巧

2020-07-22 10:37:17

CNA和CNV data

cr.什么是CNA和CNV?When I search for what is CNV, the term CNA also pops up in every article which makes me confused because I am not from a biology background. So far my understanding is, both CNVand CNA are duplication, insertion, deletion of base pairs. F.

2020-07-21 11:09:35

本体论:Gene Ontology (基因本体)

cr.gene Ontology (基因本体论) cr.Gene Ontology-基因产物功能数据库cr.ontology-documentation来源:为了查找某个研究领域的相关信息,生物学家往往要花费大量的时间,更糟糕的是,不同的生物学数据库可能会使用不同的术语,好比是一些方言一样,这让信息查找更加麻烦,尤其是使得机器查找无章可循。Gene Ontology就是为了解决这种问题而发起的一个项目。本体是给定领域内的知识体系的形式表示。 本体通常由一组类(或术语或概念)组成,并且它们之间

2020-07-15 20:33:27

同构网络vs异构网络

同类网络是指所有节点在网络中具有相同功能的网络,在执行的基本功能中,用户之间可以互相切换。 例如,在陆线电话网络中,每个节点(用户)基本上执行与其他任何节点相同的功能,并且人们使用电话的原因都相同。 通常电信网络通常是同类网络。异构网络是按功能和效用将节点分为两类或更多类的网络,在Honeybook市场网络上,活动策划者的行为与摄影师不同,摄影师与花店的行为有所不同。 eBay上的买方节点与卖方节点在网络中代表的内容不同,所以属性也不同。cr.https://guides.co/g/the.

2020-07-13 21:44:10

Biological Pathways 生物途径(通路)

Abiological pathwayis a series of interactions among molecules in a cell that leads to a certain product or a change in a cell. Such a pathway can trigger the assembly of new molecules, such as a fat or protein. Pathways can also turn genes on and off, o..

2020-06-23 12:16:26

【算法】递归

Q1:输入:print(tupleise(7, [10, 99, 35, 40]))输出:[(7, 10), (7, 99), (7, 35), (7, 40)]参考代码:def tupleise(value, items): if len(items) == 1: return [(value, items[0])] return [(value, items[0])] + tupleise(value, items[1:])print(

2020-06-09 23:37:25

【算法】计算时间复杂度

O(n)小于等于 o(n)小于 Ω(n)大于等于 ω(n)大于 Θ(n)等于 判断时间复杂度

2020-06-07 22:35:06

【算法】贪心

活动安排问题描述:给很多电影的开始和结束时间,看每个电影之间需要间隔3分钟,返回看尽可能多的电影的个数。编写函数max_num_movies(movie_list),movie_list 是(start_time, end_time) 元组。样例:movie_times = [ (299, 330), (250, 350), (280, 297), (340, 360), (360, 380), (300, 337)]print(max_n

2020-06-07 22:26:41

【2020 24字】

AAgreeable melancholy(悲伤).BBroken inside. But I can't let this gone any further.CCan we make up in the morning. Make up-Sam Kim. Can you focus on me. Focus-H.E.RDHalf of you, half and half, and half of. Just the tip of the iceberg. D(Half Moon

2020-05-28 19:20:38

非合作博弈

非合作博弈(Non-cooperative Game)又称非合作决策。非合作博弈是指一种参与者不可能达成具有约束力的协议的博弈类型,这是一种具有互不相容味道的情形。非合作博弈研究人们在利益相互影响的局势中如何选决策使自己的收益最大,即策略选择问题。 负和博弈和零和博弈统称为非合作博弈,正和博弈亦称为合作博弈。N人非合作扩展型对策,是考虑其它局中人的行动和自己行动所处的位置。设这种有两个局中人,对策规则规定:第1步局中人甲选择1或2,并把选择结果告诉局中人乙。乙再选择1或2,乙选完后,对策结束。若二局

2020-05-29 19:17:01

【算法】图 (6) 最小生成树Prim

Prim算法的核心为:保证树的权重总和相加最小distance[]:表示 某个点 还未被加入最小生成树的时候 离当前的生成树的距离parent[]:前结点in-tree[]:该点是否被访问过输入样例:graph_string = """\ U 7 W 0 1 5 0 2 7 0 3 12 1 2 9 2 3 4 1 4 7 2 4 4 2 5 3 3 5 7 4 5 2 4 6 5 5 6 2 """转化为邻接表:adj_list = ..

2020-05-18 14:10:40

【算法】图 (5) 强连通图

如何判断一个图是强连通图?强连通图(strongly connected):在一个图中,任意两点x,y,都可以互相到达(可以借助其他点作为中转);1 简单方法对每个结点进行DFS或者BFS搜索,如果每次搜索的结果,使得每个点的state都标记为“Processed”,则表示该图为强连通图,时间复杂度为,其中是DFS的时间复杂度;2 通过hub来判断强连通图先验知识:2.1 图的转置图中所有的点不变,但是所有的边的方向都反向输入样例:graph_string = ""

2020-05-18 13:46:45

【算法】图 (4) 拓扑排序

D 40 20 11 23 2拓扑序列:(一定是在有向图中)3,0,1,20,3,1,20,1,3,2D 4(只有4个点,没有边)有多少种拓扑序列?答:n!=n*(n-1)*(n-2)…*2*1(因为每个点的入度都为0)1 根据入度的定义求拓扑序列入度:有向图中某点 作为图中边的终点 的次数之和。每次挑选一个入度为0的点,然后记录该点,删除该点以及其相邻的边,更新其他点的入度;继续挑选,记录删除;如此以往得到的序列就为拓扑序列。to be continu..

2020-05-18 13:25:23

【算法】图 (3) Depth-first-search

BFS通过队列FIFO来访问顶点,而DFS通过(call)stack来实现FILO,每次访问到最深的的点。1 BFS伪代码(可以先跳过这一节)DFS-TREE DFS-LOOP2 时间复杂度假设点|V|=n, 边|E|=m;DFS-TREE: DFS-LOOP:DFS:3 算法分析输入样例:graph_str = """\ U 7 1 2 1 5 1 6 2 3 2 5 3 4 4 5 """利用上一节-图的初始化(1)-将字符串转换为邻

2020-05-18 12:24:56

【算法】图 (2) Breath-first-search 宽度优先搜索

States of vertices during traversal(遍历时顶点的状态):Undiscovered:还没遍历到该点 Discovered:遍历到该点了,但是对于该点的操作还没有结束 Processed:操作已结束Predecessor tree(前结点树):parent[],parent[1]=2,表示1的parent(前结点)是2.BFS的本质是借助了队列,DFS的本质是借助了栈(通过递归隐式借助栈)1BFS伪代码BFS-TREE:初始化需要的数据,..

2020-05-18 02:15:34

【算法】图 (1) 初始化

格式规定:U:undirected 无向图D:directed 有向图W:weighted 有权重的示例:(无向无权重图)U 41 30 21 0该图的邻接矩阵:该图的邻接表:输入样例:graph_string = """\U 171 21 151 612 132 1513 44 5"""1.将上述字符串转换为邻接矩阵from math import infdef adjacent_matrix(...

2020-05-18 01:41:05

【英语】每日DAKA

This is acutally a way of spoken English learning. It’s a module called DAKA in the app “交流说”.2020-04-18Cyber friendsWith the increasing popularity of more and more social applications, many yong ...

2020-04-17 23:50:25

【Python】对txt和csv的读写操作

r :仅读 r+ :读写(可读可写,若文件不存在则报错,覆盖写) w :仅写 w+:读写(可读可写,若文件不存在则创建) a :附加写 不可读 a+ :附加读写 不覆盖写txt 读with open("data/....txt", 'r') as f: data = f.read()txt 写with open('data/....txt', 'w+'...

2020-04-11 16:14:10

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