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RSS订阅原创 Grant Writing Practice: K99/R00
# Here are notes that I got from the internet.# Main reason for this blog: I am doing some proposal writing in class. I would like to write it into a format that I will use one day, which is K99/R00...
2020-03-16 19:55:36
1533
原创 git/github 【继续更新】
# thanks to Mr.Chan 的私教课！# 其他资源：https://www.runoob.com/git/git-tutorial.htmlhttps://www.runoob.com/w3cnote/git-guide.html廖雪峰的教程1. 在github平台建立一个仓库，设置权限，名字需要跟本地仓库名字一样2. 建立本地仓库在需要建立仓...
2019-12-15 23:39:58
233
原创 nonlinear growth curve model
summaryhttps://curranbauer.org/nonlinear-growth-2/1. polynomial regressionin previous blogs, 2 sectionsPolynomials pre-define specific functional forms through the choice of time coding.O...
2019-11-15 23:23:06
341
原创 polynomial regression (2)
*** How can I define nonlinear trajectories in a growth curve model?https://curranbauer.org/nonlinear-growth-2/1. what is linear regressionhttps://www.youtube.com/watch?v=CtKeHnfK5uA2...
2019-11-15 12:16:02
366
原创 growth curve analysis/trajectory analysis/growth change models on longitudinal data analysis (2)
# 继续 (1)，这里主要是上的课程的笔记# YouTube: Crurran-Bauer Analytics1. linear regression: multiple regressionhttps://www.youtube.com/watch?v=Qyw2_3cVpa0&list=PLQGe6zcSJT0V4xC1NDyQePkyxUj8LWLnD&ind...
2019-11-11 05:48:29
653
原创 growth curve analysis/trajectory analysis/growth change models on longitudinal data analysis (1)
# 初心者 有 SEM 背景# 想试图整理一下有哪些分析growth curve analysis、trajectory analysis的方法# 后期用于讨论，所以尽量用英文整理# (1) 主要是各种model的方法部分，based on publication w algorithm# (2) 主要是 growth curve analysis with longitudina...
2019-11-09 05:30:53
1045
原创 polynomial regression (1)
# 有statistic 背景# 以前只学过线性回归和知道一丢丢逻辑回归，老师们都喜欢绕过非线性回归（曲线回归）1. 什么是多项式回归，跟线性回归、逻辑回归的差别三者的对比https://www.zhihu.com/question/334897512. 曲线拟合https://zh.wikipedia.org/wiki/%E6%9B%B2%E7%B7%9A%E...
2019-11-01 22:43:20
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原创 什么是正交，函数空间，希尔伯特空间，施密特正交化，线形代数基础
# 文科生背景+学习过各种微积分# 原来不过是在理科的线性代数课堂中换了个说法。。。# 个人觉得知乎上有很多大神对很多数学和物理学的概念解释得非常好，所以cite了# 此外，youtube有非常好的 系统化的 统计课程 numericalmethodsguy 和 khan Academy (可汗学院)# google books 里面有一个也不错的统计书的资源正交多项式...
2019-11-01 10:53:48
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转载 [转] R——颜色篇
https://blog.csdn.net/Bone_ACE/article/details/47362619# 里面有比较全的颜色的代码# 我觉得很实用# 转了
2019-09-25 21:39:54
196
原创 MRI 入门资源整理
# 私人整理# 感觉比较实用的# 希望能够定期更新1. fMRI 4 dummies/babiesalmost all the basics you might need, you can find slides and dataset there (datasets might be too old)2. fMRI basics, Two important e-...
2019-09-25 21:30:54
694
原创 BIDS （1）
# 个人整理所用# multiple projec， multi-modal imaging1. BIDS 官网 Brain Imaging Data Structurehttps://bids.neuroimaging.io/里面附有所有的BIDS的功能，以及对应的coding和 ducument structure2. 操作平台： Linux， 可以 FSL+...
2019-09-25 21:13:25
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原创 MRI sequence: filter: prescan normalize
# 此blog为个人学习的知识整理所用；基本知识点都在粘贴的link上# MRI scanning machine: SIEMENS 3T Prisma 64-channel coil# cmrr sequences, ME-SMS MRI scanning1. more about the CMRR sequences, SMS-EPI 3Ttwo parts from B...
2019-09-25 02:58:27
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原创 Multi-echo Multi-band fMRI scanning and ME-ICA method
# 第一次接触MESMS(multi-band)的MRI scanning sequence，以及 ME-ICA 分析方法，在此做笔记使用# 一些因为project需要用到的tools和topics都附带对应的链接的整理，这个blog只是为了方便个人学习使用# acquisition parameters: 3T SIEMENS PRISMA, brain scanning, ME 3 e...
2019-09-18 01:37:50
958
转载 Effect size (converting eta squared to cohen's f or d)__ statistics
we used to use the partial eta squared to report the effect size of f test(anova)but on this paper who reported cohen's d, more than the eta squared"Writing strengthens orthography and alphabetic-codi...
2018-05-09 10:45:48
3806
转载 matlab 的并行运算
主要是想在server上实现 matlab 的 并行运算，问了一些人，大概有两个思路。（p.s. server上是 linux 系统）“有两种方式，一种是bash parallel processing，需要提前计算好程序的动态CPU和内存使用率在分配核心，否则会出现进程假死。另一种是MATLAB的并行，用spmd或parfor，根据具体代码修改。"最首先是关于 matlab parall
2018-01-26 11:30:41
968
转载 转载自某个blog “如果看了此文你还不懂傅里叶变换，你就掐死我吧”
由于觉得这篇文章写得太好，有担心日后没掉。所以 转载 记录http://blog.jobbole.com/70549/傅里叶分析不仅仅是一个数学工具，更是一种可以彻底颠覆一个人以前世界观的思维模式。但不幸的是，傅里叶分析的公式看起来太复杂了，所以很多大一新生上来就懵圈并从此对它深恶痛绝。老实说，这么有意思的东西居然成了大学里的杀手课程，不得不归咎于编教材的人实在是太严肃了。（您
2018-01-24 09:30:03
404
转载 微积分 笔记
因为作为一个文科生，所以对于数学的记忆只停留在 解析几何中的 求导数 幸好当年擅长然后发现了 微积分 可以用 这个东西来解释，但是在文科生的世界里并没有人真正讲过身边理工科生太多，解释了。然后知乎一下，对的下面是 知乎 的网址： 为什么要发明和使用微积分https://www.zhihu.com/question/26505298
2018-01-18 11:59:15
953
原创 Image registration (longitudinal studies) in SPM
主要阅读下面的这一篇paper，关于怎么用 spm 12 中新增的 toolbox 做的 longitudinal registration，然后在这里面提到的一些概念的解读以及data的来源都可以在下面的网页中找到。这篇paper 是：Symmetric diffeomorphic modeling of longitudinal structural MRIJohn Ash
2018-01-16 11:43:48
752
原创 linux, how to define a new array in bash
https://www.youtube.com/watch?v=rpYNIjd6HHUthis website will help
2017-10-31 22:42:19
289
转载 [初学笔记] matlab中的nargin系列函数
1 narginnargin 用于调控function的执行中的变量的输入个数用于判定输入变量的个数，从而在不同变量个数的 状况下实现不同的 功能因此一般在function里面会设置好默认值只有一个输出变量，和多个输入变量如果输入变量只有a个，那么在run这个function的时候，只能run的变量必须是a个或者少于a个，但不能多于a个，这样matlab是跑不了的例
2017-10-27 09:50:40
1625
转载 [初学笔记] matlab中eval，evalin，evalc的用法
参考书本《matlab N个实用技巧 第二版》刘焕进 等，北京航空航天大学出版社eval （）把括号内的字符串执行为语句可以实现多个字符串的同时执行比如，load mat 文件以及执行相关的功能的循环，可以直接使用eval语句来联合执行http://blog.csdn.net/sinat_32547403/article/details/53256463
2017-10-27 09:08:15
5798
转载 [初学笔记] matlab中 提高代码效率 的 技巧
参考，转自http://developer.51cto.com/art/201104/255128_all.htmhttp://developer.51cto.com/art/201104/255128_1.htm1 M-Lintcode analyzer preferencesset in the file--preferences--....2 prof
2017-10-24 16:20:37
437
转载 [初学笔记] matlab的 gui
下面是 matlab 里面的 file exchange部分的 gui，有很多不同类型的 guihttp://cn.mathworks.com/matlabcentral/fileexchange/?utf8=%E2%9C%93&term=gui下面是一个easy gui 的入门http://www.cnblogs.com/zjutlitao/p/3883817.html
2017-10-24 15:52:17
355
转载 [初学笔记]matlab的具体类型图形命令函， bar条形图
转自http://www.cnblogs.com/vanker/p/4245315.htmlmatlab help document1 二维图形的函数命令bar 长条图errorbar 图形加上误差范围fplot 较精确的函数图形polar 极座标图hist 累计图rose 极座标累计图stairs 阶梯图stem 针状图fill 实心图
2017-10-24 08:51:43
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转载 [初学笔记] matlab的 二维绘图 plot 和系列功能
1 plot 的用法要使用plot函数来绘制图形，需要执行以下步骤：通过指定要绘制函数的变量x的值的范围来定义x。定义函数，y = f(x)调用plot命令，如下：plot(x，y)以下示例将演示该概念。下面绘制x的值范围是从0到100，使用简单函数y = x，增量值为5。创建脚本文件并键入以下代码 -x = [-100:10:100];y = x.^2;
2017-10-20 10:42:03
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转载 [初学笔记] matlab中 keyboard的使用
keyboard 函数是用来调试的转自 这个bloghttp://blog.163.com/zhaojing8319@126/blog/static/1921923720107319150614/https://zhidao.baidu.com/question/114425830.html有点类似于调试时候做的breakpoint这个选项时，手动选择 contin
2017-10-18 18:34:48
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转载 [初学笔记] matlab中 switch和if 语句的区别和效率问题
因为写代码时候，发现这两个语句可以相互混着使用。然后搜了一下，这个blog总结的很好http://www.cnblogs.com/pangchunlei/p/5420491.html1 switch和if语句 的 使用的区别下面是直接粘贴过来的总结：switch语句和if语句的区别： ● 大于等于（>=）、小于等于（ ● switch语
2017-10-18 17:07:53
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原创 [初学笔记] matlab报错 Maximum recursion limit of 500 reached. Use set(0,'RecursionLimit',N)
如题的问题，我是在写function的时候出现的网上有人的解释是 超出了递归限制~~然后貌似加上一个语句就可以了，改一下递归限制，set(0,'RecursionLimit',1000) 但是有解释是说，这样电脑会crash掉。。。https://zhidao.baidu.com/question/96237182.html?qbl=re
2017-10-18 16:47:00
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转载 [初学笔记]matlab中 访问单元格数组 cell 的内容
碰到一个问题，cell的引用，以及调用，用cell来画图转载自这个bloghttp://blog.csdn.net/u011171235/article/details/51148519cell的访问:1.X= C(s)使用这种"()"形式的返回的是cell类2.X = C{s}使用这种"{}"形式的返回的是cell中的内容3.其他的基本上与通常的数
2017-10-12 15:18:59
1982
原创 [初学笔记] matlab中优化测试 profiler的工具使用， profile相关的命令
这里主要是整理了一下profile的工具使用的资源和步骤，里面测试使用的是我自己的代码**1 profile的功能是什么http://blog.sina.com.cn/s/blog_65d4610b0100rayl.html用profile可解决的问题：1、避免不必要的计算2、改动代码避免耗时的函数3、储存一定的结果，避免重复计算 profile
2017-10-12 11:19:17
3217
原创 [初学笔记]matlab中主函数和次函数的建立和调用（嵌套与不嵌套），全局变量global与子函数的使用
1 全局变量和子函数使用全局变量的话，那么无论在主函数和子函数中，都是通用的一个定义的变量。并且global所定义的全局变量应当现在主函数中进行定义。如果使用了global，那么主函数和子函数应当分开在两个m文件里头，二者不能同时放在一个m文件，不然无法调用使用了global的主函数，其格式中并不需要有function对了为了区分其他的变量，全局变量一般是用大写的
2017-10-12 09:52:48
20596
原创 [初学笔记] matlab中 函数m文件创立，匿名函数的建立和调用
创建函数的两种方式（1）m文件（2）匿名函数按照书本的步骤进行的（1）下面是我的function文件function y = ellipse(x)y = sqrt(9-x^2);并保存名字为‘ellipse’的m文件里面下面是命令窗口运行的原命令函>> y = ellipse(4)y = 0.0000 + 2.64
2017-10-12 09:02:12
3998
原创 [初学笔记] matlab中的while loop中使用break语句的新理解和运用: 计算和赋值放到循环里头
这个下午为了改这段代码改了一下午。纠结的点是：1 为什么break语句不发挥作用，依然死循环2 break发挥作用了，但只有一次重新输入机会3 break一次重新输入后，gender的输出依然是第一个错误结果，没有被overwrite用到的运算步骤必须放到循环里面，不然break语句无法执行下面是我自己的代码，留意其中很重要的计算部分cig2 = isemp
2017-10-11 17:10:52
3368
原创 [learning materials] radicals
https://ling-lingchinese.com/worksheets/这个网页比较齐全
2017-10-09 18:01:11
259
原创 [learning materials] quiz on pinyin, stroke, tone and semantics
1 pinyin and semantics quiz可以自己输入材料，然后让被试进行选择https://www.mdbg.net/chinese/dictionary?page=charquizhttps://www.mdbg.net/chinese/dictionary?page=chardict2 tone recognitionhttp://pinyin.q
2017-10-09 17:57:01
310
原创 [learning materials] tone and phonetics
1 tones and phoneticshttp://www.easymandarin.cn/online-chinese-lessons/chinese-phonetics/Initials:b p m f d t n l g k h j q x z c s zh ch sh r y w
2017-10-09 14:42:29
454
原创 [learning materials] writing learning
这里有很多资源可以用http://www.mandarintools.com/shufa.htmlapps1 skritterhttps://skritter.com/2 cwm-4.0 Chinese writing masterhave exe.standard versionhttps://chinese-writing-ma
2017-10-09 14:10:28
766
原创 [learning materials] pinyin foundation and writing foundation by UNC
the content of the whole websitehttp://www.learnnc.org/lp/editions/mandarin1/contentsContentsAcknowledgmentsAbout this textbook1Pinyin foundations1.1About Pinyin1.2The structure
2017-10-09 14:03:36
245
原创 linux_Problem when trying to run shell script : No such file or directory
even when you chmod, and nano, it's messy codeor the error report says that, it is binary filescould ref to this websitehttps://askubuntu.com/questions/611456/problem-when-trying-to-run-shel
2017-09-30 12:06:26
304
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